Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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