Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms