Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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