Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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