Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ctnna3-201ENSMUST00000075099 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Synm-203ENSMUST00000207102 3388 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm12475-201ENSMUST00000119476 1389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ube2uos-201ENSMUST00000142634 608 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps41-201ENSMUST00000173587 980 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.6 ms