Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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