Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21060J3KMU4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms