Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms