Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8220F6YKI2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms