Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm21977F6U3N7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm21977F6U3N7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm21977F6U3N7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21977F6U3N7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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