Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N2

Ptprh, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprhE9Q0N2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprhE9Q0N2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms