Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Ddx60E9PZQ1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Ddx60E9PZQ1 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ddx60E9PZQ1 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ddx60E9PZQ1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ddx60E9PZQ1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ddx60E9PZQ1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ddx60E9PZQ1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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