Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms