Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3543D3Z235 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm3543D3Z235 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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