Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SafbD3YXK2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms