Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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