Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cttnbp2B9EJA2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms