Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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