Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Phf11bB4XVQ1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms