Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms