Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NhsB1AV60 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms