Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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