Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Scn3aA2ASI5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Scn3aA2ASI5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Scn3aA2ASI5 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Scn3aA2ASI5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Scn3aA2ASI5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Scn3aA2ASI5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Scn3aA2ASI5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn3aA2ASI5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms