Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rtf1A2AQ19 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rtf1A2AQ19 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms