Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms