Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc25a53A2AF28 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc25a53A2AF28 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc25a53A2AF28 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc25a53A2AF28 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Slc25a53A2AF28 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc25a53A2AF28 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc25a53A2AF28 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc25a53A2AF28 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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