Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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