Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms