Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Mbd3Q9Z2D8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mbd3Q9Z2D8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Mbd3Q9Z2D8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Mbd3Q9Z2D8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mbd3Q9Z2D8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mbd3Q9Z2D8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mbd3Q9Z2D8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mbd3Q9Z2D8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mbd3Q9Z2D8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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