Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pdpk1Q9Z2A0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdpk1Q9Z2A0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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