Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms