Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms