Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mpdu1Q9R0Q9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mpdu1Q9R0Q9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms