Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms