Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndrg3Q9QYF9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms