Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms