Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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