Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms