Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ybx3Q9JKB3 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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