Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trim39Q9ESN2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trim39Q9ESN2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trim39Q9ESN2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trim39Q9ESN2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trim39Q9ESN2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trim39Q9ESN2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trim39Q9ESN2 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms