Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ush1cQ9ES64 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ush1cQ9ES64 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ush1cQ9ES64 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ush1cQ9ES64 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ush1cQ9ES64 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ush1cQ9ES64 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ush1cQ9ES64 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ush1cQ9ES64 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms