Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn2Q9ER65 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms