Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fip1l1Q9D824 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms