Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem54Q9D7S1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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