Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms