Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sgms2Q9D4B1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms