Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef12Q9D2F1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms