Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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