Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgo1Q9CXH7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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