Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp23Q9CX11 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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